Tentei o pdfparser mas ele pega os dados sem todos juntos em texto plano, alguns separados por espaços e returns. Pelo que vi dá pra capturar o que quero usando um jogo de explodes no PHP mas vi dar ujm grande trabalho.
Eu estou fazendo o seguinte no momento: Converto o PDF para HTML neste site: http://www.pdfonline.com/easyconverter/sdk/pdf-to-html/index.htm , e leio as classes CSS através do JQuery. O bom que este site gera o código com ótima formatação, fora a separação em classes.