Cara tenta uma dessas opções.
1)
SELECT DISTINCT
(N.IDNOTA) AS ID_NF,
CONVERT (VARCHAR,N.DTEMISSAO,103) AS DT_EMISSAO,
(T.DSAPELIDOTRANSPORTADORA) AS TRANSPORTADORA,
(O2.IDOCORRENCIA) AS ID_OCORRENCIA,
(TPO.DSTIPOOCORRENCIA) AS OCORRENCIA,
FROM GKOSCF.FMNOTA N
LEFT JOIN (select TOP 1 O.IDOCORRENCIA FROM GKOSCF.FMOCORRE ORDER BY O.IDOCORRENCIA DESC) O2 ON N.IDNOTA = O2.IDMOVIMENTO
LEFT JOIN GKOSCF.FCTRANSP T ON N.IDTRANSPORTADORA = T.IDTRANSPORTADORA
LEFT JOIN GKOSCF.FCTPOOCO TPO ON O.IDTIPOOCORRENCIA = TPO.IDTIPOOCORRENCIA
WHERE N.DTEMISSAO > '01/01/2017'
AND N.CDSERIE = '3'
2)
SELECT DISTINCT TOP 1
(N.IDNOTA) AS ID_NF,
CONVERT (VARCHAR,N.DTEMISSAO,103) AS DT_EMISSAO,
(T.DSAPELIDOTRANSPORTADORA) AS TRANSPORTADORA,
(O.IDOCORRENCIA) AS ID_OCORRENCIA,
(TPO.DSTIPOOCORRENCIA) AS OCORRENCIA,
FROM GKOSCF.FMNOTA N
LEFT JOIN GKOSCF.FMOCORRE O ON N.IDNOTA = O.IDMOVIMENTO
LEFT JOIN GKOSCF.FCTRANSP T ON N.IDTRANSPORTADORA = T.IDTRANSPORTADORA
LEFT JOIN GKOSCF.FCTPOOCO TPO ON O.IDTIPOOCORRENCIA = TPO.IDTIPOOCORRENCIA
WHERE N.DTEMISSAO > '01/01/2017'
AND N.CDSERIE = '3' AND O.DATAOCORRECIA = (SELECT MAX(O.IDOCORRENCIA) FROM GKOSCF.FMOCORRE O2 where O2.IDOCORRENCIA = O.IDOCORRENCIA)
ORDER BY O.IDOCORRENCIA DESC
abraço.
