Pessoal, queria alterar esse código pra, invés de colocar o nome do arquivo direto no script, dar entrada digitando o nome dos arquivos na linha de comando.
segue o script do programa
from modeller import *
env = environ()
aln = alignment(env)
mdl = model(env, file='1R26', model_segment=('FIRST:A','LAST:A'))
aln.append_model(mdl, align_codes='1r26_A', atom_files='1R26.pdb')
aln.append(file='LbrM.01.0300.fasta', alignment_format='FASTA', align_codes='LbrM.01.0300')
aln.align2d()
aln.write(file='LbrM.01.0300-1r26_A.ali', alignment_format='PIR')
aln.write(file='LbrM.01.0300-1r26_A.pap', alignment_format='PAP')
aln.write(file='LbrM.01.0300-1r26_A.fasta', alignment_format='FASTA')
Queria poder dar entrada nos parametros e nos arquivos pela linha de comando. Em perl, fazemos isso com o ARGV, tentei o sys.argv aqui mas da erro.
Alguém poderia me ajudar?