Jhonas
Veja se poderia ser algo de configuração do meu mysql, estou utilizando a versão 5.5.20, pois na questão do milisegundos sempre retorna 000000 ?
SELECT DATE_FORMAT( NOW(3), '%a %e %b %y, %T %f' );
->Tue 17 Jan 17, 20:53:42 000000
select DATE_FORMAT(SYSDATE(),'%Y%m%d%H%i%s%f');
-> 20170117205342000000