entrada de arquivos pelo terminal

[Crhisllane]

Pessoal, queria alterar esse código pra, invés de colocar o nome do arquivo direto no script, dar entrada digitando o nome dos arquivos na linha de comando.

segue o script do programa

from modeller import *

env = environ()

aln = alignment(env)

mdl = model(env, file='1R26', model_segment=('FIRST:A','LAST:A'))

aln.append_model(mdl, align_codes='1r26_A', atom_files='1R26.pdb')

aln.append(file='LbrM.01.0300.fasta', alignment_format='FASTA', align_codes='LbrM.01.0300')

aln.align2d()

aln.write(file='LbrM.01.0300-1r26_A.ali', alignment_format='PIR')

aln.write(file='LbrM.01.0300-1r26_A.pap', alignment_format='PAP')

aln.write(file='LbrM.01.0300-1r26_A.fasta', alignment_format='FASTA')

Queria poder dar entrada nos parametros e nos arquivos pela linha de comando. Em perl, fazemos isso com o ARGV, tentei o sys.argv aqui mas da erro.

Alguém poderia me ajudar?

[Gregory Pacheco]

arquivo = raw_input("Informe o caminho+nome do arquivo")

aln.append(file=arquivo, alignment_format='FASTA', align_codes='LbrM.01.0300')