Resolvido:
Obrigado pela ajuda pessoal, segue solução, desta forma exporto para Excel e faço um pouco diferente, vou calcular a média e não o menor tempo, assim terei o resultado esperado:
/*Retorna a diferença em segundos, de um Bip para Outro*/
SELECT
reg_atual.pn,
reg_atual.descricao,
reg_anterior.bip AS bipInicial,
reg_atual.bip AS bipFinal,
TIMEDIFF(STR_TO_DATE(reg_atual.bip, '%d/%m/%Y %H:%i:%s'), STR_TO_DATE(reg_anterior.bip, '%d/%m/%Y %H:%i:%s')) as tempo
FROM
mesaproducao AS reg_atual
LEFT JOIN
mesaproducao AS reg_anterior
ON reg_anterior.id < reg_atual.id
GROUP BY reg_anterior.id