vê se funciona agora...
<?
$hora_inicio = mktime(6,00,05);
echo "Data de inicio: ".date('H:i:s',$hora_inicio);
$hora_atual = mktime();
echo "<br>Data atual: ".date('H:i:s',$hora_atual);
$diferenca = $hora_atual - $hora_inicio;
echo "<br>A diferença é de ".date('H',$diferenca)." HS e ".date('i',$diferenca)." min";
?>