O dir > nome.txt vai dar um dir no sistema e salvar o conteúdo no arquivo, então não é aconselhável pois o arquivo não ficará vazio. Você pode utilizar o copy NUL nome.txt como o SK15 falou, ou se quiser jogar o conteúdo manualmente ainda existe o copy con nome.txt O prompt ficará vazio e tudo o que você digitar será adicionado no arquivo. Cada enter será uma quebra de linha dele, e quando terminar, dê um F6 e um enter que o arquivo é salvo.